Navarra no acude a los campeonatos nacionales de selecciones autonómicas.
Navarra no participó en el campeonato nacional de selecciones autonómicas de fútbol sala sub-18 masculina, que se han disputado entre el 27 y el 30 de diciembre de 2009 en las diversas sedes escogidas para tal fase.
Del mismo modo, Navarra no participará en el campeonato nacional de selecciones autonómicas de fútbol sala femenino en categoría absoluta, que se va a disputar del 8 al 10 de enero de 2010.
No es la primera vez que ocurre esto, ya que ocurrió lo mismo con dos selecciones de campo a finales del año pasado; La selección de fútbol femenina sub-18 o la selección masculina amateur para la Copa de las Regiones de UEFA, las cuales tampoco se formaron y Navarra no fue a competir sin que la Federación Navarra diese ni haya dado hasta la fecha, ninguna explicación al respecto.